Вопросы к зачету по курсу «Компьютерные методы в науке»

1.     Развитие компьютерной техники за период с зарождения первых ЭВМ до современного состояния.

2.     Генетика, геномика, протеомика, структурная геномика: понятие и место в современной науке.

3.     Биоинформатика: понятие, основные области приложения.

4.     Особенности использования ресурсов Интернет в молекулярной биологии.

5.     Первичные базы данных. Понятие, виды, использование на практике.

6.     Геномные и нуклеотидные базы данных. Различия и применение в работе.

7.     Вторичные базы данных. Отличие от первичных, виды, использование на практике.

8.     Базы данных по вторичным структурам белков и РНК. Использование на практике.

9.     Что такое «биочипы»? Определение, характеристика, использование.

10.  Определение терминов «гомология» и «сходство». Алгоритмы поиска гомологии первичных структур. Сервисы BLAST.

11.  Выравнивание первичных структур. Алгоритмы, их отличия, области применения.

12.  Функциональный анализ последовательностей белков. Использование сервиса PROSITE и др.

13.  Инструменты протеомики: краткая характеристика, области применения.

14.  Структурный анализ. Методы определения структур макромолекул – какие существуют, области применения, достоинства и недостатки.

15.  Базы данных по структурам макромолекул и по структурным классификациям белков.

16.  Предсказание структур белков и РНК. Поиск структурной гомологии между белками.