Вопросы к зачету по курсу «Компьютерные методы в науке»
1. Развитие компьютерной техники за период с зарождения первых ЭВМ до современного состояния.
2. Генетика, геномика, протеомика, структурная геномика: понятие и место в современной науке.
3. Биоинформатика: понятие, основные области приложения.
4. Особенности использования ресурсов Интернет в молекулярной биологии.
5. Первичные базы данных. Понятие, виды, использование на практике.
6. Геномные и нуклеотидные базы данных. Различия и применение в работе.
7. Вторичные базы данных. Отличие от первичных, виды, использование на практике.
8. Базы данных по вторичным структурам белков и РНК. Использование на практике.
9. Что такое «биочипы»? Определение, характеристика, использование.
10. Определение
терминов «гомология» и «сходство». Алгоритмы поиска гомологии первичных
структур. Сервисы BLAST.
11. Выравнивание первичных структур. Алгоритмы, их отличия, области применения.
12. Функциональный анализ последовательностей белков. Использование сервиса PROSITE и др.
13. Инструменты протеомики: краткая характеристика, области применения.
14. Структурный анализ. Методы определения структур макромолекул – какие существуют, области применения, достоинства и недостатки.
15. Базы данных по структурам макромолекул и по структурным классификациям белков.
16. Предсказание
структур белков и РНК. Поиск структурной гомологии
между белками.